Prometheus,
1) В синаптике выбираешь нужный софт, из контекстного меню - отметить для установки, потом жмешь "применить".
2) Со сторонних сайтов надо качать т.н.
пакеты Debian (файлы с расширением *.deb), вот здесь
http://xneur.ru/Загрузки, он перенаправляет на
http://gq.net.ru/ubuntu. Можно добавить в репозиторий, а можно и напрямую. После скачивания просто дважды кликаешь на файле, и запускается установка.
3) Что касается разделов, то - Gparted.