[Alex Lion]

Ну, во-первых, лучше оставить население в живых, должен же кто-то работать, то есть оружия массового поражения не катят, разве что в качестве угрозы уничтожения планеты в случае отказа от принятия власти захватчиков.
Раз о нападении никто не подозревал, то войска соответственно не мобилизованы. Наверно есть небольшая регулярная армия, ну и отряды, отвечающие за внутреннюю безопасность. Если расположение подобных частей известно, то вполне логично взорвать их и поставить гражданских перед фактом. Или попытаться провести что-то вроде "кровавой ночи". То есть внедрить отряд шпионов, чтобы узнали всё о верхушке власти, её структуре и т.п. А потом в одну прекрасную ночь всех перерезали и возможно, если есть чем, зашантажировали полезные структурные ячейки.
Кстати, любопытный вариант. А если обойтись тупо без силы, на самом деле через шантаж заставить правительство работать на себя? Вроде идеальный вариант, население ничего не узнает, а доходы и налоги будут загребать захватчики) Правда это больше походит на каких-нибудь рейдеров, чем на допустим имперские войска. Хотя ведь и в реальной истории есть примеры, когда часть правящей элиты представляла собой интересы других стран или шпионили.